対潜の低い睦月型改で1-5ボスマスのflagshipソ級相手にシミュレーションした結果三式ソナー×3だと28%位の確率で仕留め切れずに残りますね
ダメージ計算機の所をクリックで結果見れます
https://jervis.vercel.app/?p=U6jqbO_irCU
対して三式ソナー+三式爆雷投射機+九五式爆雷だと96%位の確率で確殺します
https://jervis.vercel.app/?p=U4YI-Z249_4
３点セットの対潜合計値が三式ソナー×3より低くても対潜値に乗算でかかる三点シナジーの倍率がダメージに表れた結果ですね

対潜値の低い睦月型改のレベル99で1-5ボスマスのflagshipソ級相手にシミュレーションした結果三式ソナー×3だと28%位の確率で仕留め切れずに残りますね
ダメージ計算機の所をクリックで結果見れます
https://jervis.vercel.app/?p=U6jqbO_irCU
対して三式ソナー+三式爆雷投射機+九五式爆雷だと98%で確殺します
https://jervis.vercel.app/?p=U4YI-Z249_4
装備による対潜値の合計が三式ソナー×3より低くてもシナジー倍率の乗算の方が対潜のダメージに大きく影響した結果です

質問主です。
開発可能な対潜装備のみで改めて「対潜火力」を計算した結果、最低クラスの三点シナジー「九三ソ＋九四投＋九五爆」より「三式水中」３積みの方が若干高い結果になりました。
ただし三点の方は装甲減少補正が加わるため、「ダメージ」なら三点の方が大きいという事なのでしょうね。
参考になりました。ありがとうございました。

艦これwikiの三式ソナーのページのコメント欄に同じ質問があるのでそれを見てもらうとして
https://wikiwiki.jp/kancolle/%E4%B8%89%E5%BC%8F%E6%B0%B4%E4%B8%AD%E6%8E%A2%E4%BF%A1%E5%84%80

結論をいうとニ種と三種のシナジー倍率は基礎攻撃力に倍率でかかる為に倍率の高い三種シナジーの方が対潜は高くなる
レベル上がって対潜上がると更に乗算で対潜の数値にかかる為にニ種シナジーと三種シナジーの対潜の差は開いていく
三式ソナー+三式爆雷投射機+九五爆雷の三種シナジーセットが開発可能な装備のみだと１番対潜高い。二式爆雷は常設任務で何個か手に入るんであれば変える

３ソ3投95爆雷が開発できるもので高火力。ダメージ量は相手によるので潜水鰆水鬼(装甲93)だと割合も出ます。

イベント海域での対潜レベリングを視野に書いていますが、
ここ2回適した地点がないですねー..
後は4-5-1,5-5-1が通常海域での対潜先制爆雷攻撃レベリング候補です。

＞大型ソナーに3種のシナジーがないとはどういうことなのでしょうか？

掲載の通りで、仮に
【零式水中聴音機】【爆雷投射機(A)】【爆雷】の装備をした場合、
1.4375倍ではなく1.265倍になると認識しています。

参考元はこちらですね(記事にも反映します)
https://twitter.com/KennethWWKK/status/1454281174877028359

※回答時に秋月型で追試してみましたが、補正値は
1.15(ソナー系×爆雷系)×1.10(爆雷×爆雷投射機A)の1.265で大丈夫そうです。

＞零式水中聴音機の対潜値は11です。
報告ありがとうございます。更新しました。

零式水中聴音機の対潜値は11です。