こちらで把握できていないことだったので実機で試してみましたが、
確認した限りはその条件で秘書艦変更は有効に機能していそうです。
具体的には龍鳳からArk Royalに変更し、母港画面を推移せずに開発を行いましたがSwordfishを確認しました。

自己解決しました。お騒がせしました。母港に戻らなくてもきちんと反映されているようです。

wikiで解説されていないか確認していた最中、二式複戦 屠龍の開発で検証できるのではないかと思いつきました。
あきつ丸が秘書艦で20/40/10/120の資源配分にすれば屠龍の開発率12％、代わりに開発理論値内なのに爆戦や彗星一二型が開発できなくなるようです。
空母を秘書艦にして（念のため）いったん母港に戻り、編成画面であきつ丸に秘書艦を変更して工廠画面に遷移して開発開始。初回で屠龍が出ましたので冒頭のとおり検証完了ということで…。

例えば、空母系を秘書艦娘にして開発したあとに、工廠画面から編成画面に直接遷移して秘書艦娘を変更（例えば水雷系）し、再び編成画面から工廠画面に直接遷移した場合、一連の操作で母港画面には一度も戻っていませんが、これでも担当の秘書艦娘の変更（例だと空母系→水雷系）は有効に機能しているのでしょうか。

新型高温高圧缶は現時点で開発不可能な装備です。
天津風改(20レベ)、天津風改二(73レベ、☆7を2つ)の持参が基本ですね。

報告ありがとうございます。
4%で間違いないです。
修正しますー

目次については開いておくか閉じておくか迷っているのですが、
全記事を開いておくか閉じておくかの2択なんですよねー…
あまりに目次が長い記事が多いので、特にスマホが懸念で閉じている状態です。

少し考えてみますね

報告ありがとうございます。
コメントいただいた通り、秋月型と金剛型は2025/01/28以前のデータで記事を更新していたため
おかしい数値となっていました。

取り急ぎになりますが、該当の部分について記事内修正しましたー。
(スパムに入っていて確認遅くなりました）

それたぶん元になってるデータが秘書艦でフィルターされてないから水雷以外のデータも混ざってるので低い
poiDBで三ソ(水雷系)と零戦21(空母系)のデータ見ると10/10/10/20のデータはどっちも44万回になってます

もちろん私がミスしているかもしれません。間違っていたら申し訳ありません。

艦これの開発は、開発できるものはすべての装備が最低2％以上、2%刻みの開発となっていて、
私の知る限り例外はありません。

例えば海外の掲示板の方では、
駆逐艦を秘書艦にすると、
[発煙装置(煙幕)]：+2%
[8cm高角砲]：-2%
とされていて、煙幕の代わりに8cm高角砲が減っていることがわかります。

示されているサンプルがどういうものなのかはわからないですが、
例えば開発出来ない旗艦(戦艦や空母)での10/10/10/20が入っているなら、
極端に数字が少ないことも起こり得るかと思います。

見た感じ煙幕に開発率を吸われているような…